شجرة تطور جيني لفيروس مرض التهاب الشعب الهوائية المعدي
الدكتور ميلاد ابراهيم عريبي
نتحدث في هذا المقال عن شجرة تطور جيني لسلالة ميدانية من فيروس مرض التهاب الشعب الهوائية المعدي (Infectious Bronchitis Virus - IB) وبعض اللقاحات المرتبطة به .
التقسيم الجيني
السلالة الميدانية و المعاملة من قبل العالم الدكتور ميلاد ابراهیم عریبي (IB2.F Melad/Iraq IB Field Strain) تظهر قريبة جينيا من السلالات اللقاحية مثل GI-23 IS/1494/06 Vaccine Strain.
السلالة الميدانية أقرب جينيا إلى السلالات الموجودة في الفرع العلوي للشجرة (GI-23 وGI-21 وGI-12) مقارنة بالسلالات مثل H120 وMass41 الموجودة في الجزء السفلي.
المسافات الجينية
الأرقام الموجودة على الخطوط (الفروع) تمثل الفروقات الجينية. حيث الاحظ أن هناك فرقا جينيا ملحوظا بين السلالات الموجودة في الفرع العلوي والسفلي. والسلالة الميدانية تظهر مسافة جينية أصغر مع اللقاح GI-23 مقارنة بالسلالات الأخرى.
دعم الفروع
القيم الموضوعة على الفروع (مثل 100، 95، 90) تشير إلى درجة موثوقية تقسيم الفروع. القيم العالية (مثل 100) تعني دعم قوي للعلاقات التطورية بين السلالات.
يمكن استخدام هذه الشجرة لتحديد مدى كفاءة اللقاحات في التعامل مع السلالة الميدانية. وبناءً على الشجرة، السلالات القريبة جينيا من السلالة الميدانية (مثل GI-23) قد تكون أكثر فعالية. السلالات البعيدة (مثل Mass41 وH120) قد تكون أقل تأثيراً، مما يستدعي تحديث برامج التحصين.
ملاحظات
بناءً على مخطط هذه الشجرة، فقد تحتاج السلالة الميدانية إلى لقاحات مخصصة أو برامج تحصين معدلة لتعزيز فعاليتها. كما تحتاج تحليلا جينيا إضافيا قد يُظهر مزيد من التفاصيل حول علاقة السلالات الميدانية باللقاحات الأخرى.
